Fabuła „The Carpenter's Son” opiera się na apokryfie z II wieku naszej ery, „Ewangelii Dzieciństwa Tomasza”, który opisuje dzieciństwo Jezusa. Film skupi się na części życia świętej rodziny, która ukrywa się w Egipcie. Syn (Noah Jupe), znany tylko jako Chłopiec, zaczyna się buntować, odkrywając tym samym wrodzone moce, których jeszcze do końca nie rozumie. Kiedy zaczyna z nimi eksperymentować, ściąga na siebie i swoją rodzinę nadzwyczajne i nadprzyrodzone koszmary.